为什么有的共定位图片中叶绿体通道是玫红色?
在拟南芥、、玉米、大麦、小麦等材料中,种植培养苗子时是正常接受光照的,叶片中含有大量叶绿体,而叶绿素在640nm左右的激发光下可产生红色的自发荧光。当在这些含叶绿体较多的受体材料中做共定位实验时,共定位marker一般为红色荧光(在560nm左右的激发光下),实验及共聚焦拍摄时两个波长通道的荧光互不影响,但视野下看着比较混淆,尤其叠加后二者不易分清,因此只是在颜色显示上将叶绿体自发荧光设置为玫红色,以显示和共定位marker的区别。
主要方法
免疫荧光技术:利用抗原与的特异性结合原理,将荧光标记的与细胞内的目标蛋白结合,然后通过荧光显微镜观察荧光信号的位置,从而确定目标蛋白的亚细胞定位。
绿色荧光蛋白(GFP)融合蛋白技术:将绿色荧光蛋白基因与目标蛋白基因融合,构建成融合蛋白表达载体。当该载体在细胞中表达时,产生的融合蛋白会带有绿色荧光,可直接通过荧光显微镜观察其在细胞内的分布,进而确定目标蛋白的亚细胞定位。
标准分类器在蛋白质亚细胞定位中的评估:Debasish Mohapatra 等人对三种标准分类器(Classification And Regression Tree,CART;K-Nearest Neighbor,KNN;Support Vector Machine,SVM)在蛋白质亚细胞定位预测中的性能进行了比较。实验结果表明,SVM 在准确性和宏观平均精度方面表现较好,而 CART 在宏观平均召回率和宏观 F1 分数方面表现较好。
基于 AdaBoost Learner 的蛋白质亚细胞定位预测:Yu-Huan Jin 等人介绍了一种基于 AdaBoost Learner 的蛋白质亚细胞定位预测方法。该方法利用蛋白质的氨基酸组成进行预测,通过 Jackknife 交叉验证和独立数据集测试表明,AdaBoost 是一种稳健有效的模型,预测准确率高于其他现有预测器。
以上信息由专业从事亚细胞定位服务的贝科新肽于2025/5/1 8:21:59发布
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